Otoimmün hastalıklarının nedenleri tam olarak bilinmemekle birlikte, genetik ve çevresel faktörler sonucu ortaya çıktığı tahmin edilmektedir. Kadınlarda, erkeklere oranla daha sık görülen bu hastalıklar, sigara, alkol, hamilelik gibi durumlarla tetiklenebilir.